特別是行政體制對(duì)于按照市場(chǎng)機(jī)制形成的綜合物流一體化體系具有制約作用。但是，我們也不可忽視我國(guó)將港口作為一種準(zhǔn)公共資源執(zhí)行國(guó)家戰(zhàn)略職能的傳統(tǒng)特征。這兩方面的職能對(duì)社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展作用上都各有干秋。但是，如果兩方面職能不能通過(guò)一種統(tǒng)一的協(xié)調(diào)機(jī)制加以協(xié)調(diào)，而通過(guò)一種法制安排加以統(tǒng)一，使我國(guó)海運(yùn)業(yè)的發(fā)展適應(yīng)世界海運(yùn)產(chǎn)業(yè)發(fā)展大趨勢(shì)的要求，那么，任何一種職能都將無(wú)法實(shí)現(xiàn)。我國(guó)當(dāng)前管理體制制約作用主要表現(xiàn)：

（1)港口產(chǎn)權(quán)方面的問(wèn)題我國(guó)港口的產(chǎn)權(quán)按企業(yè)的關(guān)系和所有制關(guān)系分級(jí)管理的模式。港口主管機(jī)構(gòu)既是部門又是經(jīng)營(yíng)部門。現(xiàn)行的港口體制滯后于港口市場(chǎng)的發(fā)展要求，制約著港航制度化協(xié)調(diào)機(jī)制的建立。

（2)港口行政管理方面，我國(guó)各級(jí)行政主管部門與地方政府對(duì)港口的參與和影響過(guò)多，有些方面干擾了港口企業(yè)的運(yùn)營(yíng)。港口企業(yè)缺乏自主權(quán)，完全服從于政府的行政權(quán)力，海運(yùn)經(jīng)營(yíng)業(yè)與港口產(chǎn)業(yè)兩者都無(wú)法滿足自身戰(zhàn)略的發(fā)展需要，更無(wú)法滿足港航制度化協(xié)調(diào)機(jī)制建立的條件。

（3)港口法律保障方面存在的問(wèn)題采取的是漸進(jìn)的方式，改革的設(shè)計(jì)只是為了解決某些急迫的問(wèn)題，缺少長(zhǎng)遠(yuǎn)的改革戰(zhàn)略。由于缺少長(zhǎng)遠(yuǎn)的迎接世界海運(yùn)業(yè)競(jìng)爭(zhēng)的挑戰(zhàn)的目標(biāo)，時(shí)下的體制形成的港口與航運(yùn)經(jīng)營(yíng)業(yè)之間協(xié)調(diào)機(jī)制的“斷層”似乎很難通過(guò)市場(chǎng)機(jī)制來(lái)解決。頒布的法操作性和動(dòng)態(tài)適應(yīng)性不強(qiáng)。立法的基礎(chǔ)與遠(yuǎn)景視野相對(duì)薄弱，同時(shí)政策執(zhí)行的透明度與法制貫徹效果相對(duì)滯后。執(zhí)法部門間權(quán)責(zé)不清、責(zé)權(quán)倒置及交叉的結(jié)果是港口產(chǎn)業(yè)監(jiān)控缺乏權(quán)威性和統(tǒng)一性。

同時(shí)，由于賦予了地方政府在戰(zhàn)略中的諸多行政權(quán)利，進(jìn)一步造成港口重復(fù)建設(shè)，甚至形成了目前的大量港口閑置現(xiàn)象。各地在海運(yùn)業(yè)立足本國(guó)積極參與國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)問(wèn)題上，忽視了我們海運(yùn)企業(yè)如何參與國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)。完善且明確法制體系是推進(jìn)港航建設(shè)的必要前提。法律保障上的缺失，使我國(guó)港航供應(yīng)鏈制度化協(xié)調(diào)機(jī)制難以建立起來(lái)。